TCRcloud

TCRcloud 是一款基于 Python 的工具，旨在对自适应免疫受体库 (AIRR) 数据进行可视化和分析。它兼容 Linux、macOS 和 Windows (通过 WSL)，并要求输入符合 AIRR 标准的数据。 其核心功能包括： - 可视化：生成 CDR3 词云（可通过 JSON 自定义颜色）、V-gene 图表以及 2D 或 3D 氨基酸图。 - 多样性分析：创建雷达图以比较多样性指数，包括 Distinct CDR3、Convergence、D50 Index、Gini Coefficient、Shannon Index、Gini-Simpson Index 和 Chao1 index。 - 数据集成：包含利用 AIRR 库元数据文件从符合 AIRR 标准的数据库下载重排文件的功能。 - 数据导出：允许将雷达图和 V-gene 图中计算的指数及处理后的数据导出为文本文件。