TCRcloud

TCRcloudは、適応免疫受容体レパートリー（AIRR）データの可視化と分析のために設計されたPythonベースのツールです。Linux、macOS、Windows（WSL経由）に対応しており、入力としてAIRR準拠のデータを必要とします。 主な機能は以下の通りです： - 可視化：CDR3ワードクラウド（JSONによる色カスタマイズ可能）、V-geneプロット、および2次元または3次元のアミノ酸プロットを生成します。 - 多様性分析：Distinct CDR3、Convergence、D50 Index、Gini Coefficient、Shannon Index、Gini-Simpson Index、Chao1 indexを含む多様性指標を比較するためのレーダーチャートを作成します。 - データ統合：AIRRレパートリーメタデータファイルを使用して、AIRR準拠のデータベースから再構成ファイルをダウンロードする機能を備えています。 - データエクスポート：レーダーチャートおよびV-geneプロットから計算された指標や処理済みデータをテキストファイルにエクスポートできます。