TCRcloud

TCRcloud es una herramienta basada en Python diseñada para la visualización y el análisis de datos del Repertorio de Receptores Inmunes Adaptativos (AIRR). Es compatible con Linux, macOS y Windows (a través de WSL) y requiere datos compatibles con AIRR como entrada. Las capacidades clave incluyen: - Visualización: Genera nubes de palabras de CDR3 (con coloración personalizable mediante JSON), gráficos de genes V y gráficos de aminoácidos en 2D o 3D. - Análisis de Diversidad: Crea gráficos de radar para comparar índices de diversidad, incluyendo Distinct CDR3, Convergence, D50 Index, Gini Coefficient, Shannon Index, Gini-Simpson Index y el índice Chao1. - Integración de Datos: Incluye funcionalidad para descargar archivos de reordenamiento de bases de datos compatibles con AIRR utilizando archivos de metadatos de repertorio AIRR. - Exportación de Datos: Permite exportar los índices calculados y los datos procesados de los gráficos de radar y de genes V a archivos de texto.