منصوبے کے بارے میں

TCRcloud ایک Python پر مبنی ٹول ہے جسے Adaptive Immune Receptor Repertoire (AIRR) ڈیٹا کی ویژولائزیشن اور تجزیے کے لیے ڈیزائن کیا گیا ہے۔ یہ Linux، macOS، اور Windows (WSL کے ذریعے) کے ساتھ ہم آہنگ ہے اور ان پٹ کے طور پر AIRR-compliant ڈیٹا کی ضرورت رکھتا ہے۔ اس کی اہم صلاحیتوں میں شامل ہیں: - ویژولائزیشن: CDR3 ورڈ کلاؤڈز (JSON کے ذریعے قابلِ تبدیلی رنگوں کے ساتھ)، V-gene پلاٹس، اور 2-D یا 3-D امینو ایسڈ پلاٹس تیار کرتا ہے۔ - تنوع کا تجزیہ (Diversity Analysis): متنوع انڈیکسز کا موازنہ کرنے کے لیے ریڈار پلاٹس بناتا ہے، جن میں Distinct CDR3، Convergence، D50 Index، Gini Coefficient، Shannon Index، Gini-Simpson Index، اور Chao1 index شامل ہیں۔ - ڈیٹا انٹیگریشن: AIRR repertoire میٹا ڈیٹا فائلوں کا استعمال کرتے ہوئے AIRR-compliant ڈیٹا بیسز سے rearrangement فائلیں ڈاؤن لوڈ کرنے کی فعالیت فراہم کرتا ہے۔ - ڈیٹا ایکسپورٹ: ریڈار اور V-gene پلاٹس سے کیلکولیٹڈ انڈیکسز اور پراسیس شدہ ڈیٹا کو ٹیکسٹ فائلوں میں ایکسپورٹ کرنے کی اجازت دیتا ہے۔