عن المشروع

TCRcloud هي أداة قائمة على لغة Python مصممة لتصور وتحليل بيانات ريبرتوار مستقبلات المناعة التكيفية (AIRR). وهي متوافقة مع أنظمة Linux وmacOS وWindows (عبر WSL) وتتطلب بيانات متوافقة مع معايير AIRR كمدخلات. تشمل القدرات الرئيسية ما يلي: - التصور: إنشاء سحب كلمات CDR3 (مع إمكانية تخصيص الألوان عبر JSON)، ومخططات V-gene، ومخططات أحماض أمينية ثنائية أو ثلاثية الأبعاد. - تحليل التنوع: إنشاء مخططات رادارية لمقارنة مؤشرات التنوع، بما في ذلك Distinct CDR3 وConvergence وD50 Index وGini Coefficient وShannon Index وGini-Simpson Index وChao1 index. - تكامل البيانات: تتضمن وظائف لتنزيل ملفات إعادة الترتيب من قواعد بيانات متوافقة مع AIRR باستخدام ملفات البيانات الوصفية لريبرتوار AIRR. - تصدير البيانات: تتيح تصدير المؤشرات المحسوبة والبيانات المعالجة من المخططات الرادارية ومخططات V-gene إلى ملفات نصية.