TCRcloud

TCRcloud é uma ferramenta baseada em Python projetada para a visualização e análise de dados de Repertório de Receptores Imunes Adaptativos (AIRR). É compatível com Linux, macOS e Windows (via WSL) e requer dados em conformidade com AIRR como entrada. As principais capacidades incluem: - Visualização: Gera nuvens de palavras CDR3 (com coloração personalizável via JSON), gráficos de genes V e gráficos de aminoácidos 2-D ou 3-D. - Análise de Diversidade: Cria gráficos de radar para comparar índices de diversidade, incluindo Distinct CDR3, Convergence, D50 Index, Gini Coefficient, Shannon Index, Gini-Simpson Index e índice Chao1. - Integração de Dados: Inclui funcionalidade para baixar arquivos de rearranjo de bancos de dados compatíveis com AIRR usando arquivos de metadados de repertório AIRR. - Exportação de Dados: Permite exportar índices calculados e dados processados de gráficos de radar e de genes V para arquivos de texto.