clinosim

clinosim 是一个临床现实的医院数据模拟器，旨在以 HL7 FHIR R4 格式生成合成的电子健康记录 (EHR) 数据。与从静态疾病分布中采样的传统工具不同，clinosim 使用前向模拟模型，其中每个患者都具有一个隐藏的 14 变量生理状态。所有观察结果，包括实验室结果、生命体征、药物和诊断，都从该动态状态中衍生出来，确保生成的数据在临床上是连贯的。例如，服用华法林的患者将表现出治疗性的 PT-INR 水平，这些水平在停药后会下降，而不是仅仅从正常范围内采样。 该工具对于创建用于医学 AI 和机器学习模型的训练数据、测试 EHR 系统、开发临床研究方法以及生成教育案例数据集特别有用。它原生支持美国和日本的医疗保健标准，符合 JP Core 16 个主要 FHIR 资源类型的配置文件，并包括 JLAC10 和 MHLW YJ 代码，以及日本姓名和地址。该系统可以通过 YAML 驱动的配置进行扩展，涵盖 32 种住院疾病和 46 种急诊/门诊条件，而无需更改代码。 clinosim 还支持纵向服务线，包括肿瘤学（具有化疗周期和肿瘤标记物）和产科（将怀孕建模为具有产前检查和分娩遭遇的时间限定生命周期）。输出是完全合成的，不涉及或引用任何真实患者数据，因此在开发和测试环境中是安全的。该项目是基于 MIT 许可证的开源项目，需要 Python 3.11 或更高版本。