mne-bids-pipeline

O MNE-BIDS-Pipeline é um pipeline de processamento completo para dados de MEG e EEG. Ele opera em conjuntos de dados organizados de acordo com a Estrutura de Dados de Imagens Cerebrais (BIDS) e usa MNE-Python internamente. Principais capacidades descritas no README: - Processamento automatizado de dados de MEG e EEG, desde dados brutos até soluções inversas. - Configuração por meio de um arquivo de texto simples. - Relatórios extensivos de processamento e análise. - Processamento de um único participante ou centenas de participantes em paralelo. - Execução por meio de um utilitário de linha de comando fácil de usar. - Mensagens de erro úteis quando algo dá errado. - Processamento de dados como uma sequência de etapas padrão. - Cache de etapas para evitar recomputação desnecessária. - Os dados podem ser "ejetados" do pipeline em qualquer estágio, evitando dependência. - Roda em um laptop, um servidor poderoso ou um cluster de alto desempenho (por exemplo, SLURM) via Dask. A documentação de instalação e uso está hospedada em mne.tools/mne-bids-pipeline. O projeto reconhece que o pipeline original de MEG/EEG com MNE-Python foi construído conjuntamente pela Equipe de Cognição e Dinâmica Cerebral e pela Equipe MNE Python, com base em scripts desenvolvidos para uma publicação de 2018 na Frontiers in Neuroscience. A iteração atual é baseada em BIDS e depende das extensões BIDS para EEG e MEG, referenciando os artigos EEG-BIDS e MEG-BIDS. As diretrizes de contribuição são fornecidas em CONTRIBUTING.md.