À propos du projet

MNE-BIDS-Pipeline est un pipeline de traitement complet pour les données MEG et EEG. Il fonctionne sur des ensembles de données organisés selon la structure de données d'imagerie cérébrale (BIDS) et utilise MNE-Python en interne. Principales capacités décrites dans le README : - Traitement automatisé des données MEG et EEG, des données brutes aux solutions inverses. - Configuration via un simple fichier texte. - Rapports récapitulatifs complets de traitement et d'analyse. - Traitement d'un seul participant ou de centaines de participants en parallèle. - Exécution via un utilitaire en ligne de commande facile à utiliser. - Messages d'erreur utiles en cas de problème. - Traitement des données comme une séquence d'étapes de traitement standard. - Mise en cache des étapes pour éviter les recalculs inutiles. - Les données peuvent être « éjectées » du pipeline à n'importe quelle étape, évitant ainsi un verrouillage. - Fonctionne sur un ordinateur portable, un serveur puissant ou un cluster haute performance (par exemple, SLURM) via Dask. La documentation d'installation et d'utilisation est hébergée sur mne.tools/mne-bids-pipeline. Le projet reconnaît que le pipeline MEG/EEG original avec MNE-Python a été construit conjointement par l'équipe Cognition and Brain Dynamics et l'équipe MNE Python, sur la base de scripts développés pour une publication Frontiers in Neuroscience de 2018. L'itération actuelle est basée sur BIDS et s'appuie sur les extensions BIDS pour l'EEG et le MEG, en référence aux articles EEG-BIDS et MEG-BIDS. Les directives de contribution sont fournies dans CONTRIBUTING.md.