このプロジェクトについて
MNE-BIDS-Pipelineは、MEGおよびEEGデータのための本格的な処理パイプラインです。Brain Imaging Data Structure(BIDS)に従って整理されたデータセットを操作し、内部でMNE-Pythonを使用します。
READMEに記載されている主な機能は以下の通りです:
- 生データから逆解法までのMEGおよびEEGデータの自動処理。
- シンプルなテキストファイルによる設定。
- 広範な処理および分析の要約レポート。
- 単一の参加者または数百人の参加者を並列処理。
- 使いやすいコマンドラインユーティリティによる実行。
- 問題発生時の役立つエラーメッセージ。
- 標準的な処理ステップのシーケンスとしてのデータ処理。
- 不要な再計算を避けるためのステップのキャッシュ。
- データは任意の段階でパイプラインから「排出」でき、ロックインを回避。
- ラップトップ、強力なサーバー、またはDaskを介した高性能クラスター(例:SLURM)で実行可能。
インストールおよび使用法のドキュメントはmne.tools/mne-bids-pipelineでホストされています。
このプロジェクトは、MNE-Pythonを使用した元のMEG/EEGパイプラインが、Cognition and Brain Dynamics TeamとMNE Python Teamによって共同で構築され、2018年のFrontiers in Neuroscienceの出版物用に開発されたスクリプトに基づいていることを認めています。現在のイテレーションはBIDSに基づいており、EEGおよびMEGのBIDS拡張機能に依存しており、EEG-BIDSおよびMEG-BIDSの論文を参照しています。貢献ガイドラインはCONTRIBUTING.mdに記載されています。
Comments
0 people shared their preference · Deer Point appears after 10 participants
Sign in to join the discussion.