Об этом проекте

MNE-BIDS-Pipeline — это полноценный конвейер обработки данных MEG и EEG. Он работает с наборами данных, организованными в соответствии со структурой Brain Imaging Data Structure (BIDS), и использует MNE-Python. Ключевые возможности, описанные в README: - Автоматическая обработка данных MEG и EEG от сырых данных до обратных решений. - Настройка через простой текстовый файл. - Подробные сводные отчёты по обработке и анализу. - Обработка одного участника или сотен участников параллельно. - Запуск через удобную утилиту командной строки. - Полезные сообщения об ошибках при возникновении проблем. - Обработка данных как последовательность стандартных шагов обработки. - Кэширование шагов для избежания ненужных повторных вычислений. - Данные можно «извлечь» из конвейера на любом этапе, избегая привязки к нему. - Работает на ноутбуке, мощном сервере или высокопроизводительном кластере (например, SLURM) через Dask. Документация по установке и использованию размещена на mne.tools/mne-bids-pipeline. Проект признаёт, что оригинальный конвейер MEG/EEG с MNE-Python был совместно создан командой Cognition and Brain Dynamics Team и командой MNE Python Team на основе скриптов, разработанных для публикации в Frontiers in Neuroscience 2018 года. Текущая версия основана на BIDS и опирается на расширения BIDS для EEG и MEG, ссылаясь на статьи EEG-BIDS и MEG-BIDS. Руководство по участию приведено в CONTRIBUTING.md.