nf-core/fastqrepair é um pipeline de bioinformática para recuperar arquivos FASTQ.gz corrompidos, corrigir leituras não conformes, remover leituras não emparelhadas e re-emparelhar leituras desordenadas. Ele gera arquivos FASTQ limpos e relatórios de QC.
Código aberto. Novas possibilidades.
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Um pouco de curiosidade. Um mundo de código aberto.
THE FIRST COLLECTIONPrefect é um framework de orquestração de fluxo de trabalho baseado em Python, projetado para construir, automatizar e monitorar pipelines de dados resilientes com recursos de agendamento e tentativas.
Kestra é uma plataforma de orquestração open-source e orientada a eventos, projetada para fluxos de trabalho de dados, IA e infraestrutura, utilizando uma interface declarativa em YAML.
Taipy é um framework Python projetado para cientistas de dados e engenheiros de ML criarem e implantarem aplicações web de dados e IA prontas para produção sem a necessidade de aprender linguagens de front-end.
Great Expectations (GX Core) é uma biblioteca Python de código aberto para qualidade de dados, fornecendo um framework para criar testes unitários de dados para garantir consistência e confiabilidade.
Biblioteca Python leve para pipelines de execução que usa decoradores @action, suporta retry, execução paralela, observabilidade e deploy em 34+ plataformas.
StormByte-Buffer é uma biblioteca C++26 que fornece buffers FIFO, SharedFIFO, Ring e ferramentas de pipeline para a suíte StormByte. Inclui buffers seguros e não seguros para threads, padrões produtor/consumidor e estágios de pipeline configuráveis.
marimo é um notebook Python reativo que garante a consistência entre código e saídas, armazenados como arquivos Python puros para facilitar o uso com git e a implantação.
O Tekton Pipelines fornece recursos nativos do Kubernetes para declarar pipelines de CI/CD. É cloud-native, desacoplado e tipado, usando contêineres como blocos de construção, com Tasks executáveis isoladamente e recursos intercambiáveis.