这个项目能做什么

Scientific Agent Skills 是一个开源项目，提供了 166 个即用型 Agent Skills 以及 100+ 科学数据库集成，将 AI 编程 Agent 转变为支持生物学、化学、医学、药物研发和数据分析的科研助手。 仓库内容主要包括： - **100+ 数据库集成**：统一数据库查找 Skill 覆盖 78 个公共数据库（PubChem、ChEMBL、UniProt、COSMIC、ClinicalTrials.gov、FRED、USPTO），并针对 DepMap、Imaging Data Commons、PrimeKG、NCATS ARAX、美国财政部财政数据等提供独立 Skill；通过 BioServices、BioPython、gget 等多数据库包进一步扩展覆盖。 - **70+ Python 包 Skill**：为 RDKit、Scanpy、PyTorch Lightning、scikit-learn、PyTDC、PathML、pydicom、NeuroKit2、QuTiP、GeoPandas、pymatgen、BioPython、Qiskit、OpenMM、MDAnalysis 等库提供版本感知的显式工作流。 - **9 个平台集成 Skill**：覆盖 Benchling、DNAnexus、LatchBio、OMERO、Protocols.io、Open Notebook、Ginkgo Cloud Lab、LabArchives、Opentrons。 - **30+ 分析与沟通工具**：涵盖文献综述、证据可追溯写作、同行评审、文档处理、全文论文检索、PPTX 海报与幻灯片、示意图、信息图及 Mermaid 图表。 - **10+ 研究与临床工具**：包括假设生成、基金申请撰写、聚合临床决策支持、PK/PD 建模与仿真、BIDS、ISO 标准合规证据准备、分析方法验证与方法转移、情景分析与工作流驱动 Skill 起草。 每个 Skill 附带 SKILL.md 文档、实用代码示例、用例、集成指南和参考资料；捆绑脚本的 Skill 还提供测试套件，CI 强制执行结构契约（frontmatter、链接解析和脚本解析）。 安装选项包括：npx skills 安装器、GitHub CLI gh skill 命令（支持版本固定和更新）、Cursor 和 Codex 等客户端的 Agent Plugins 打包，以及用户级或项目级目录的手动安装。 README 包含醒目的安全免责声明：Skills 可执行代码、安装包、发起网络请求并修改文件，建议仅安装所需内容、安装前阅读 SKILL.md、检查贡献历史、本地运行 Cisco AI Defense Skill 扫描器，并报告可疑行为；安全扫描定期执行，结果公开发布。 项目采用 MIT 许可证，引用了 arXiv 论文，由 K-Dense 维护，面向希望让 AI Agent 处理跨生物学、化学、医学、材料科学、物理学、地理空间分析等领域多步科学工作流的科研人员、实验室和工程师。