このプロジェクトについて

Scientific Agent Skillsは、オープンなAgent Skills標準をサポートするAIエージェント向けの、すぐ使える166のスキルを集めたオープンソースコレクションです。汎用コーディングエージェントがAPIをゼロから再発見するのではなく、科学ライブラリ、データベース、ワークフローに関する厳選されたバージョン対応のガイダンスを提供するように設計されています。 リポジトリの内容: - 100以上の科学・金融データベース統合。統一されたデータベース検索スキルは、PubChem、ChEMBL、UniProt、COSMIC、ClinicalTrials.gov、FRED、USPTOなどの78の公開データベースをカバーし、DepMap、Imaging Data Commons、PrimeKG、NCATS ARAX、U.S. Treasury Fiscal Data、Hugging Science、OneKGPd、Genomic Intelligence、AlphaGenome専用のスキルも備えています。BioServices、BioPython、ggetなどのマルチデータベースパッケージがさらにカバレッジを拡張します。 - RDKit、Scanpy、PyTorch Lightning、scikit-learn、PyTDC、PathML、pydicom、NeuroKit2、PufferLib、QuTiP、GeoPandas、pymatgen、BioPython、Qiskit、OpenMM、MDAnalysisなどのライブラリ向けに、明示的なバージョン対応ワークフローを備えた70以上の最適化済みPythonパッケージスキル。 - Benchling、DNAnexus、LatchBio、OMERO、Protocols.io、Open Notebook、Ginkgo Cloud Lab、LabArchives、Opentronsなどのプラットフォーム向けの9つの科学統合スキル。 - 文献レビュー、エビデンス追跡可能なライティング、ピアレビュー、文書処理、全文論文・規制提出文書の検索、検索統合、PPTXポスター・スライド、回路図、インフォグラフィック、Mermaid図をカバーする30以上の分析・コミュニケーションツール。 - 仮説生成、助成金申請書作成、集計型臨床意思決定支援研究、PK/PDモデリングとシミュレーション、BIDS、ISO標準対応エビデンス準備、分析法バリデーションと移管、シナリオ分析、ワークフロー由来スキルドラフト作成など、10以上の研究・臨床ツール。 各スキルにはSKILL.mdドキュメント、実用的なコード例、ユースケース、統合ガイダンス、参考資料が同梱されています。スクリプトをバンドルするスキルにはテストスイートもあり、CIはfrontmatter、リンク解決、スクリプト解析などの構造的契約を強制します。 READMEで説明されているインストールオプションには、npxスキルインストーラー、バージョン固定と更新サポートを備えたGitHub CLIのghスキルコマンド、CursorやCodexなどのクライアント向けのAgent Pluginsパッケージングが含まれます。ユーザーレベルまたはプロジェクトレベルのスキルディレクトリへの手動インストールも文書化されており、NemoClawなどアウトバウンドネットワーキングを制限するホスト向けの注意事項も記載されています。 READMEには目立つセキュリティ免責事項が含まれています。スキルはコードを実行し、パッケージをインストールし、ネットワークリクエストを行い、ファイルを変更できるため、ユーザーは必要なものだけをインストールし、インストール前に各SKILL.mdを読み、貢献履歴を確認し、Cisco AI Defenseスキルスキャナーをローカルで実行し、不審な動作を報告することが推奨されています。セキュリティスキャンは定期的に実行され、結果はリポジトリで公開されます。 このプロジェクトはMITライセンスで、arXiv論文を引用し、K-Denseがコミュニティの貢献とともに維持しています。生物学、化学、医学、材料科学、物理学、地理空間解析および関連分野にわたるマルチステップの科学ワークフローをAIエージェントに処理させたい研究者、ラボ、エンジニアを対象としています。