Sobre el proyecto
Scientific Agent Skills es una colección de código abierto de 166 habilidades listas para usar para agentes de IA que admiten el estándar abierto Agent Skills. Está diseñada para ofrecer a un agente de codificación de propósito general orientación curada y sensible a la versión para bibliotecas científicas, bases de datos y flujos de trabajo, en lugar de depender de que el agente redescubra las APIs desde cero.
Lo que contiene el repositorio:
- Más de 100 integraciones de bases de datos científicas y financieras. Una habilidad unificada de búsqueda de bases de datos cubre 78 bases de datos públicas, como PubChem, ChEMBL, UniProt, COSMIC, ClinicalTrials.gov, FRED y USPTO, con habilidades dedicadas para DepMap, Imaging Data Commons, PrimeKG, NCATS ARAX, Datos Fiscales del Tesoro de EE. UU., Hugging Science, OneKGPd, Inteligencia Genómica y AlphaGenome. Los paquetes multibase como BioServices, BioPython y gget extienden aún más la cobertura.
- Más de 70 habilidades optimizadas de paquetes Python con flujos de trabajo explícitos y conscientes de la versión para bibliotecas como RDKit, Scanpy, PyTorch Lightning, scikit-learn, PyTDC, PathML, pydicom, NeuroKit2, PufferLib, QuTiP, GeoPandas, pymatgen, BioPython, Qiskit, OpenMM y MDAnalysis.
- 9 habilidades de integración científica para plataformas como Benchling, DNAnexus, LatchBio, OMERO, Protocols.io, Open Notebook, Ginkgo Cloud Lab, LabArchives y Opentrons.
- 30+ herramientas de análisis y comunicación que cubren revisión de literatura, escritura con trazabilidad de evidencia, revisión por pares, procesamiento de documentos, recuperación de artículos completos y archivos regulatorios, integraciones de búsqueda, pósteres y diapositivas PPTX, esquemáticos, infografías y diagramas Mermaid.
- 10+ herramientas de investigación y herramientas clínicas que incluyen generación de hipótesis, redacción de propuestas de subvención, investigación ideal para apoyo a la decisión clínica, modelado y simulación PK/PD, BIDS, preparación de evidencia acorde a estándares ISA, validación y transferencia de métodos analíticos, análisis de escenarios y borradores de habilidades derivadas de flujos de trabajo.
Cada habilidad se distribuye con un documento SKILL.md, ejemplos de código prácticos, casos de uso, guía de integración y material de referencia. Las habilidades que incluyen guiones también disponen de un conjunto de pruebas, y la CI aplica requisitos estructurales como frontmatter, resolución de enlaces y análisis de scripts.
Las opciones de instalación descritas en el README incluyen el instalador de habilidades npx, el comando GitHub gh con fijación de versiones y puntos de extensión, y el empaquetado como complemento para clientes como Cursor y Codex. La instalación manual en directorios de usuario o de proyecto también se documenta, además de notas para entornos como NemoClaw que restringen el tráfico entrante.
EL README incluye un aviso de seguridad importante: las habilidades pueden ejecutar código, instalar paquetes, realizar solicitudes de red y modificar archivos; por lo tanto, se recomienda instalar solo lo necesario, leer el SKILL.md de cada habilidad, verificar historial de contribuciones, ejecutar el analizador de seguridad Cisco AI Defense localmente y notificar comportamiento inusual. Ejecución de escaneos se ejecuta periódicamente y se publican los resultados.
El proyecto se distribuye con licencia MIT, cita un artículo de arXiv y está mantenido por K-Dense. La comunidad contribuye a él y está dirigido a investigadores, laboratorios e ingenieros que deseen utilizar un agente de IA para llevar a cabo flujos de trabajo multi-etapa en biología, química, medicina, ciencia de materiales, física, análisis geoespacial, entre otros.
Comments
0 Rating appears after 10 ratings
Sign in to join the discussion.