fermiviewer

FermiViewer 是一款用于电子显微镜图像分析的开源应用程序，支持 TEM/STEM 成像、EELS、EDS 和衍射技术。它能够处理广泛的文件格式，包括 Gatan DM3/DM4/DM5、Velox/NCEM EMD、Bruker BCF、TIA SER、MRC、HDF5 变体（hspy, NeXus, 通用 h5）、MSA/EMSA 光谱、JEOL、EDAX、Lispix、TIFF（包含来自 Thermo Fisher/FEI, Zeiss, ImageJ 的元数据）、常见图像格式（PNG/JPEG/BMP/GIF）、无文件头 RAW、Bruker Nanoscope AFM 以及 4D-STEM（Merlin, HyperSpy）。 该工具提供全面的分析能力：EELS（背景扣除、映射、定量分析、厚度测量、Kramers-Kronig 分析、Fourier-log、基于模型的峰拟合、SVD）；EDS（Cliff-Lorimer/ZAF/ζ-factor 成分分析、映射、伪影校正、峰拟合）；4D-STEM 虚拟探测器成像（BF/ABF/ADF/自定义光阑）；衍射（相机长度校准、斑点检测、相位索引、d-间距）；GPA 应变、CTF 估计、原子柱检测、颗粒和晶粒分析（使用 k-means、分水岭及 paint-to-train 分类器）、截面层和界面粗糙度分析、FFT 滤波、漂移对齐，以及一套完整的测量/注释工具。 FermiViewer 采用 Python (FastAPI) 后端和 React 前端，并使用 Tauri 桌面壳层构建原生应用程序。它提供多种安装方式：Windows 安装程序、独立服务器、PyPI 包以及适用于物理隔离环境的离线包。该应用程序包含具有文件夹监控和宏记录/回放功能的批处理功能，以及用于脚本编写和自动化的无头 Python API (fermiviewer.api)。文档包括一个详细的 wiki，其中包含入门指南、分析研讨会和 API 参考。